Триквел включает в себя три новых транспортных средства, пять замков с головоломками, улучшенную графику (включая обновлённые спрайты главного героя), допиленные уровни, новых злых боссов и новую музыку …

По сюжету - Темное проклятие превратило соседний регион Радаксиан в пустошь. Зеленые долины Хананотани (Hananotani) теперь заполнены страшными монстрами и заброшенными деревнями. После поражения Янкена появились новые пять Повелителей Демонов, во главе с жестоким генералом Фурио они хотят поработить весь Miracle World.

Во время своих приключений Алекс встречает двух девушек. Наокото - принцесса воспитанная по кодексу Бусидо (из игры Shinobi World) и Стелла - напарница Алекса (из игры Lost Stars).

Алекс очень влюблён в Наокото, хотя у него нет выбора, потому что её отец Синоби обещал отрубить ему голову, если он её бросит. Стелла тренировалась с Алексом с самого детства, и в тайне испытывает к нему нежные чувства, но сам Алекс относится к ней как к своей сестре, из за чего у них очень напряженные отношения.

В Miracle World 3 - всего 16 уровней. Действие в каждом из них происходит в разных ареалах обитания, а их прохождение иногда усложняют обычные препятствия как шипы, лава или болотные ямы. Кроме этого на некоторых этапах можно заметить изображения в виде пасхалок к другим старым играм Sega - как Sonic The Hedgehog, Wonder Boy и Psycho Fox …

В конце восьмого уровня Алекс встречает Стеллу которая просит спасти из заточения своего отца - Короля Хананотани, а сама отправляется на поиски их пропавшего учителя Святого Нурари.

Что бы спасти Короля нужно найти тайный проход к его темнице в третьем замке. От него Алекс узнает что их учитель находится в самом центре «Реки Лавы» (Lava Lake), отравленный ядом и прикованный к скале. С целью спасти Нурари, Алекс отправляется в Небесный Замок что бы достать противоядие (Bottle Of Life) …

Несмотря на изменённую графику, игровой процесс остался прежним. Алекс как всегда вынужден собирать местную валюту (баумы), для покупки полезных предметов в магазине, хотя внешний вид всех предметов, как и сам продавец сильно изменились (Теперь это не улыбчивый усатый торговец, а антропоморфный одноглазый хряк) …

Внешний облик транспортных средств тоже потерпел изменения. Вместо мотоцикла теперь можно купить автомобиль, вместо моторной лодки водяной скутер, а вместо вертолёта волшебное облако «Кинто- Ун» (Magic Cloud «Kinto-Un»), хотя способ управления этими машинами остался прежним …

В игре появились новые приспешники: Metal Head, Fuck Off Head, Yubitsume Head, с которыми как обычно нужно дважды сразится в стиле «Джен, Кен, Пон» … Во время битвы с финальным боссом, Алекс узнает что Фурио когда то давно сражался с его учителем, в результате чего лишился руки и всё это время мечтал отомстить …

После победы над ним, Великий совет и Оракул назначили Алекса Царем королей. Но молодой герой отказался от этого титула и предложил вместо себя своего брата Эгла.

В Miracle World 3 по прежнему нет никаких сохранений, но если на счету у игрока есть хотя бы 2500 баумов (долларов), то он может получить ещё одно продолжение (Continue) …